跟蹤誤差指的是指數基金收益率與標的指數(或基準)收益率之間偏差的波動情況，跟蹤誤差越大，說明基金的凈值收益率與標的指數收益率之間的差異越大。作為對指數基金評價最重要的指標之一，很多投資者對跟蹤誤差是怎么形成的并不清楚。筆者在此將跟蹤誤差的主要原因歸結成三個方面：(一)基金大額申購贖回導致的倉位變化；(二)股票停牌估值調整；(三)其它原因。下面逐一為大家解讀這三類原因對指數基金跟蹤誤差的影響。
(一)基金大額申購贖回導致的倉位變化
(1)大額申購對指數跟蹤誤差的影響。大額申購對于指數基金的影響主要在于稀釋基金次日漲跌幅。例如，2015年10月23日中證醫療指數漲幅4.86%，而跟蹤該指數的廣發中證醫療指數基金當日凈值漲幅僅為1.61%，差異原因在于22日有大額申購，當日申購的資金享受次日的漲跌幅，但由于資金結算原因，該筆資金第二天尚未到賬，基金經理無法及時建倉，所以稀釋了當天基金的漲幅。同理，如果第二天指數大跌，大額申購資金也會稀釋當天基金的跌幅。舉個形象的例子，就好比你準備好了一桌菜，本來計劃來一桌人，結果到飯點的時候突然來了兩桌客人，此時就算你再神通廣大也來不及準備兩桌菜，結果就成了一桌菜兩桌人吃，只是大家都只能少吃點。
(2)大額贖回對指數跟蹤誤差的影響 .大額贖回對于指數基金凈值影響主要表現在兩方面：第一方面，贖回發生的贖回費對于基金凈值的影響。第二方面，贖回賣出的價格對指數基金的影響。
贖回費對基金凈值的影響：由于基金合同一般規定贖回費歸入基金凈資產的部分不低于不低于25%，這是對繼續持有者的保護。當前股票型基金的贖回費絕大多數在0.5%以上，假設某基金突發98%的份額贖回，并且贖回費的25%歸入基金凈資產，不考慮其它因素影響，該筆大額贖回對當天凈值增厚可達6.125%，這就使得凈值日漲跌幅與指數產生偏離。
贖回賣出的價格對指數基金的影響：由于投資者贖回的份額按照當天的收盤凈值確認，但是對應的贖回倉位一般是要次日之后才賣出，由于賣出價與當日收盤價存在偏差，故也會對次日基金凈值產生影響。假定某基金發生20%的大額贖回，若第二天對應指數盤中最高漲4%，最低跌4%，收盤時候漲幅為0%，不考慮其它因素，若基金經理在最高點將贖回對應倉位全部賣出，那么相當于這部分贖回對于當天基金凈值影響為正1%，反之若基金經理在最低位全部賣出，那么贖回對于該基金當天凈值影響為負1%。
(二)停牌票估值調整對指數跟蹤誤差的影響
由于現時規定長期停牌的股票要按照證監會(AMAC)行業指數進行估值調整，而指數不會對停牌票進行估值調整，因此二者之間的差異可能產生跟蹤誤差。例如，假設某指數基金觸發估值調整的停牌股票占30%，按照規定基金資產里面的停牌成份股市要按照指數收益法進行調整，而對應的指數里面的停牌成份股每天漲跌幅為0，不會對指數點位有影響。若當天停牌股對應的AMAC指數上漲3%，則停牌票對于基金的凈值是增厚0.9%，反之，若對應的AMAC指數下跌3%，則停牌票對于基金的凈值是減少0.9%。
另外停牌票復牌后，由于用指數收益法調整的股票估值和實際交易價格可能有較大偏差，也會導致當天基金凈值和指數漲跌幅產生偏差。例如，中證國防軍工指數2016年2月18日下跌了2.21%，而跟蹤該指數的某基金凈值當日僅跌了0.64%，主要原因是當天指數成份股航天科技（000901）復牌，停牌期間其對應的AMAC指數累計下跌37%，導致調整后的航天科技股票估價為33.06元，而復牌首日盡管跌停，但盤中已打開跌停且成交活躍，按照有關估值規定，其當日在基金中的估值應為收盤價47.59元，相當于該股一天漲幅44%，導致了該基金的當天的凈值漲跌幅與跟蹤指數的漲跌幅產生較大偏離。
(三)其它原因
除以上提及的原因外，影響指數基金跟蹤誤差的因素還包括現金余額、成份股調整、成份股分紅、各種費用支出以及管理人經驗與運作水平等原因。
首先，如何減弱成份股調整對指數基金跟蹤誤差的影響是考驗基金管理人綜合能力的一個重要方面。合格的指數基金經理會提前預判調入或調出成份股未來價格變化以及流動性情況，并根據實際情況提前做好調倉準備。
其次，由于當前國內指數基金跟蹤的主要為價格指數，價格指數不考慮分紅再投資對指數的影響。而指數基金中成份股分紅以及分紅收益再投資會使指數基金產生正偏離。所以，一般而言分紅較大的指數基金正向偏離更大，更易于跟蹤。
再者，指數基金在運作過程中會產生運營成本、交易成本、管理費、托管費、指數使用費等系列費用。而這些費用會使得指數基金與標的指數之間產生負偏離，一般基金管理人會通過成份股分紅以及擇時交易等方式來減小指數基金的跟蹤的負偏差。
最后，盡管影響指數基金跟蹤誤差的因素很多，但基金管理人可以憑借經驗與流程設計，盡量降低指數基金的跟蹤誤差。
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